MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid At

Total Repeats: 9111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_003064	CTGG	2	8	156686	156693	0 %	25 %	50 %	25 %	159186514
2502	NC_003064	GA	3	6	156737	156742	50 %	0 %	50 %	0 %	159186514
2503	NC_003064	GTGCA	2	10	156760	156769	20 %	20 %	40 %	20 %	159186514
2504	NC_003064	GCC	2	6	156804	156809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186514
2505	NC_003064	CAA	2	6	156851	156856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186514
2506	NC_003064	CCTC	2	8	156879	156886	0 %	25 %	0 %	75 %	159186514
2507	NC_003064	GAG	2	6	156894	156899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186514
2508	NC_003064	CTT	2	6	156965	156970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186514
2509	NC_003064	GTT	2	6	156974	156979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159186514
2510	NC_003064	GGC	2	6	156992	156997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186514
2511	NC_003064	ATG	2	6	157008	157013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186514
2512	NC_003064	AGC	2	6	157014	157019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186514
2513	NC_003064	CGGT	2	8	157069	157076	0 %	25 %	50 %	25 %	159186514
2514	NC_003064	ACG	2	6	157260	157265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186514
2515	NC_003064	CAG	2	6	157282	157287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186514
2516	NC_003064	GCT	2	6	157562	157567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119383
2517	NC_003064	GTC	2	6	157638	157643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119383
2518	NC_003064	CTG	2	6	157659	157664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119383
2519	NC_003064	TGG	2	6	157818	157823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119383
2520	NC_003064	GCAA	2	8	157834	157841	50 %	0 %	25 %	25 %	16119383
2521	NC_003064	GC	3	6	157857	157862	0 %	0 %	50 %	50 %	16119383
2522	NC_003064	ATG	2	6	158203	158208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17938744
2523	NC_003064	ACGT	2	8	158258	158265	25 %	25 %	25 %	25 %	17938744
2524	NC_003064	ACCGT	2	10	158283	158292	20 %	20 %	20 %	40 %	17938744
2525	NC_003064	CTG	2	6	158323	158328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17938744
2526	NC_003064	CGTCTT	2	12	158954	158965	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	159186515
2527	NC_003064	TCG	2	6	158974	158979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186515
2528	NC_003064	CGC	2	6	159069	159074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186515
2529	NC_003064	CGT	2	6	159080	159085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186515
2530	NC_003064	CGGCAA	2	12	159113	159124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186515
2531	NC_003064	TTC	2	6	159602	159607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119385
2532	NC_003064	CCG	2	6	159630	159635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119385
2533	NC_003064	CAC	2	6	159665	159670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119385
2534	NC_003064	TCA	2	6	159746	159751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119385
2535	NC_003064	ATCG	2	8	159789	159796	25 %	25 %	25 %	25 %	16119385
2536	NC_003064	TTGC	2	8	159862	159869	0 %	50 %	25 %	25 %	16119385
2537	NC_003064	TTTC	2	8	159977	159984	0 %	75 %	0 %	25 %	17938747
2538	NC_003064	AGC	2	6	159995	160000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17938747
2539	NC_003064	CGA	2	6	160049	160054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17938747
2540	NC_003064	CGG	2	6	160091	160096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17938747
2541	NC_003064	GCC	2	6	160121	160126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17938747
2542	NC_003064	GGT	2	6	160144	160149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17938747
2543	NC_003064	CTG	2	6	160249	160254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17938747
2544	NC_003064	TCT	2	6	160518	160523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186516
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2549	NC_003064	GTCG	2	8	160906	160913	0 %	25 %	50 %	25 %	159186516
2550	NC_003064	CGC	2	6	160943	160948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186516
2551	NC_003064	TTC	2	6	161032	161037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186516
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2553	NC_003064	GTG	2	6	161060	161065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186516
2554	NC_003064	CGG	2	6	161100	161105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186516
2555	NC_003064	CAAT	2	8	161164	161171	50 %	25 %	0 %	25 %	159186516
2556	NC_003064	CGT	2	6	161217	161222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119387
2557	NC_003064	CGTC	2	8	161228	161235	0 %	25 %	25 %	50 %	16119387
2558	NC_003064	CCG	2	6	161285	161290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119387
2559	NC_003064	GTCATC	2	12	161365	161376	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16119387
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2561	NC_003064	GGC	2	6	161440	161445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119387
2562	NC_003064	TCG	2	6	161477	161482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119387
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2569	NC_003064	CAT	2	6	161618	161623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119388
2570	NC_003064	TCG	2	6	161647	161652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119388
2571	NC_003064	CATCT	2	10	161664	161673	20 %	40 %	0 %	40 %	16119388
2572	NC_003064	GGGGC	2	10	161764	161773	0 %	0 %	80 %	20 %	16119388
2573	NC_003064	C	6	6	161782	161787	0 %	0 %	0 %	100 %	16119388
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2579	NC_003064	GTC	2	6	162316	162321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186517
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2581	NC_003064	CGAG	2	8	162401	162408	25 %	0 %	50 %	25 %	159186517
2582	NC_003064	TGC	2	6	162410	162415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186517
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2587	NC_003064	TCA	2	6	162677	162682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186517
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2591	NC_003064	GAC	2	6	162760	162765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186517
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2593	NC_003064	TGG	2	6	162925	162930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186517
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2601	NC_003064	CGCGG	2	10	163234	163243	0 %	0 %	60 %	40 %	159186517
2602	NC_003064	CGC	2	6	163257	163262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186517
2603	NC_003064	ACCT	2	8	163270	163277	25 %	25 %	0 %	50 %	159186517
2604	NC_003064	GAA	2	6	163284	163289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186517
2605	NC_003064	GC	3	6	163357	163362	0 %	0 %	50 %	50 %	159186517
2606	NC_003064	ACTG	2	8	163398	163405	25 %	25 %	25 %	25 %	159186517
2607	NC_003064	CAA	2	6	163497	163502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186517
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2609	NC_003064	AGGG	2	8	163547	163554	25 %	0 %	75 %	0 %	159186517
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2615	NC_003064	CG	3	6	163853	163858	0 %	0 %	50 %	50 %	159186517
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2619	NC_003064	ACA	2	6	164042	164047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159186517
2620	NC_003064	CGT	2	6	164049	164054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186517
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2622	NC_003064	CG	3	6	164140	164145	0 %	0 %	50 %	50 %	159186517
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2746	NC_003064	TTAC	2	8	171843	171850	25 %	50 %	0 %	25 %	16119399
2747	NC_003064	TCA	2	6	172019	172024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119399
2748	NC_003064	GAC	2	6	172096	172101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119399
2749	NC_003064	TCA	2	6	172178	172183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119399
2750	NC_003064	TAT	2	6	172204	172209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119399
2751	NC_003064	TCC	2	6	172275	172280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159186520
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2754	NC_003064	GAT	2	6	172592	172597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186520
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2756	NC_003064	GATC	2	8	172822	172829	25 %	25 %	25 %	25 %	159186520
2757	NC_003064	AC	3	6	172833	172838	50 %	0 %	0 %	50 %	159186520
2758	NC_003064	TGG	2	6	172848	172853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186520
2759	NC_003064	CGT	2	6	172913	172918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186520
2760	NC_003064	CTT	2	6	172948	172953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159186520
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2762	NC_003064	GTC	2	6	173159	173164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186520
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2764	NC_003064	CT	3	6	173504	173509	0 %	50 %	0 %	50 %	159186520
2765	NC_003064	GCA	2	6	173526	173531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186520
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2767	NC_003064	GGC	3	9	173860	173868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119401
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2771	NC_003064	CGT	2	6	174067	174072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119401
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2777	NC_003064	CTG	2	6	174227	174232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119401
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2781	NC_003064	GC	3	6	174499	174504	0 %	0 %	50 %	50 %	16119401
2782	NC_003064	CGT	2	6	174523	174528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119401
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2784	NC_003064	CGT	2	6	174581	174586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119401
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2801	NC_003064	AC	3	6	175612	175617	50 %	0 %	0 %	50 %	16119402
2802	NC_003064	CAT	2	6	175618	175623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119402
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2854	NC_003064	CGC	2	6	179636	179641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186522
2855	NC_003064	CGG	2	6	179659	179664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186522
2856	NC_003064	GCG	2	6	179677	179682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186522
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2858	NC_003064	ACCG	2	8	179744	179751	25 %	0 %	25 %	50 %	159186522
2859	NC_003064	GCT	2	6	179793	179798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186522
2860	NC_003064	CCG	2	6	179812	179817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186522
2861	NC_003064	ATC	2	6	179847	179852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186522
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2864	NC_003064	GATC	2	8	180137	180144	25 %	25 %	25 %	25 %	159186523
2865	NC_003064	GAA	2	6	180147	180152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159186523
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2867	NC_003064	TCG	2	6	180199	180204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186523
2868	NC_003064	GCCT	2	8	180224	180231	0 %	25 %	25 %	50 %	159186523
2869	NC_003064	GAC	2	6	180288	180293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186523
2870	NC_003064	GC	4	8	180294	180301	0 %	0 %	50 %	50 %	159186523
2871	NC_003064	GCC	2	6	180339	180344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186523
2872	NC_003064	CCG	2	6	180350	180355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159186523
2873	NC_003064	GCG	2	6	180365	180370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186523
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2876	NC_003064	TCA	2	6	180647	180652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159186523
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2905	NC_003064	CGG	2	6	182585	182590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159186524
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2987	NC_003064	CGT	2	6	187911	187916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186529
2988	NC_003064	CT	4	8	187917	187924	0 %	50 %	0 %	50 %	159186529
2989	NC_003064	TGC	2	6	187938	187943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186529
2990	NC_003064	GCGT	2	8	187946	187953	0 %	25 %	50 %	25 %	159186529
2991	NC_003064	CGT	2	6	188005	188010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186529
2992	NC_003064	ACG	2	6	188012	188017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186529
2993	NC_003064	CTG	4	12	188018	188029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159186529
2994	NC_003064	GAT	2	6	188052	188057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159186529
2995	NC_003064	AGG	2	6	188139	188144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159186529
2996	NC_003064	G	6	6	188194	188199	0 %	0 %	100 %	0 %	159186529
2997	NC_003064	TGG	2	6	188514	188519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159186530
2998	NC_003064	CGGCG	2	10	188580	188589	0 %	0 %	60 %	40 %	159186530
2999	NC_003064	CGA	2	6	188677	188682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159186530
3000	NC_003064	GTGG	2	8	188726	188733	0 %	25 %	75 %	0 %	159186530

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